Экспозиция «Прошлое Тавриды», где выставлена наиболее показательная часть археологической коллекции музея, посвящена истории Крыма с древнейших времен до позднего средневековья. Изделия из кремня, кости и дерева, останки древних животных, рассказывают об эпохе камня – древнем и позднем палеолите. Богатым экспонатурным рядом представлены эпоха бронзы и раннего железа, история античной Таврики VI-II веков до н.э и Позднескифского государства, тема «Великого переселения народов» и Таврика в период поздней античности и раннего средневековья.

Отдельный раздел посвящен истории распространения христианства. В экспозиции представлен большой комплекс античной и средневековой керамической тары. Заключительные три витрины отображают национально-бытовую сторону истории средневековых государств XIV-XV вв. на территории Крыма: княжества Феодоро (Крымская Готия), генуэзских колоний (Кафа, Судак) и Крымского ханства.

Грандиозная драма, развернувшаяся на пространстве 24 тыс. кв. км. Героическая оборона Севастополя, Керченско-Феодосийская десантная операция, трагедия Аджимушкайских каменоломен.

Беспримерная борьба крымских партизан и подпольщиков в тылу врага. Операция советских войск по освобождению Крыма.

Герои и жертвы Великой войны. Выставка открыта к юбилею окончания Второй мировой войны и посвящена памяти павших героев.

Готовится реэкспозиция раздела.

История формирования нашего полуострова в различные геологические периоды,  окаменелости животных и растений, населявших его тысячи и миллионы лет назад, представлены многочисленными палеонтологическими находками.

В части зала, посвященной геологии Крыма – фотографии интересных форм рельефа, образцы уникальных и типичных минералов и горных пород, слагающих Крымский полуостров, полезных ископаемых, которыми богаты его недра.

Геологическая история Земли подразделяется на пять крупных временных отрезков – эр: архейская, протерозойская, палеозойская, мезозойская и кайнозойская. Каменная летопись Крыма донесла до нас свидетельства лишь двух последних из них – более древние отложения оказались погребены под щитом осадочных мезозойских и кайнозойских пород.

В витринах и диорамах посредством гербарных образцов, биогрупп и мокрых препаратов представлено богатство современной флоры и фауны Крыма. Совершая путешествие по всем ландшафтным зонам полуострова, в рамках каждой из них знакомимся с территориями и объектами природно-заповедного фонда Украины, характерными и редкими (в том числе, реликтовыми и эндемичными) представителями растительного и животного мира Крыма. Посещение выставки может рассматриваться как один из элементов экологического воспитания.